Справочно-поисковый аппарат научной библиотеки представлен системой каталогов и картотек (карточных и электронных), которые дают полное представление о библиотечном фонде, помогают пользователям ориентироваться в документальных потоках библиотеки и с наименьшими затратами времени подобрать информацию по интересующим вопросам. В научной библиотеке имеются электронный каталог, карточные читательские каталоги (алфавитный и систематический), генеральный алфавитный и топографический каталоги для служебного пользования.

Алфавитный каталог (АК) раскрывает содержание всего библиотечного фонда со дня основания библиотеки и  до 01.07.2015 г., расположен в читальном зале научной библиотеки.

Все карточки в алфавитном каталоге располагаются в порядке строгого алфавита фамилий авторов, наименований организаций и заглавия книг. По АК можно установить наличие в библиотеке нужного издания и узнать, какие произведения определенного автора есть в фонде научной  библиотеки. Для облегчения поиска литературы в алфавитном каталоге имеются разделители, ссылочные и справочные карточки. Все каталожные ящики в каталоге пронумерованы, на передней стенке ящика на этикетках указаны буквы или слоги первого и последнего описания в данном ящике. Это ускоряет поиск нужного ящика каталога и последующую расстановку ящиков на место.

Систематический каталог (СК) – это библиотечный каталог, в котором библиографические записи располагаются по отраслям знаний в соответствии с определенной системой библиотечно-библиографической классификации. СК находится в отделе комплектования и обработки литературы научной библиотеки, ведется с 1964 г. по настоящее время.

К систематическому каталогу нужно обращаться в том случае, если необходимо выяснить, по каким отраслям знания имеются книги в библиотеке; необходимо подобрать литературу по определенной теме, вопросу, предмету; нужно установить автора и точное название книги, если известно ее содержание. 

Каждая отрасль знаний, тема, предмет имеют свой индекс. По этим индексам, отражающим содержание книг, группируются карточки. В НБ ЮЗГУ естественные и технические науки расположены согласно Универсальной десятичной классификации (УДК), а общественные и гуманитарные науки согласно Библиотечно-библиографической классификации (ББК). Индексы указаны на карточках, разделителях, этикетках ящиков. Каждый ящик систематического каталога имеет этикетку с перечнем основных разделов каталога, помещенных в данном ящике. Внутри ящика имеются разделители, на которых дается информация о содержании литературы в каждом отделе и подразделе. Кроме того, внимательно читая информацию на разделителях, можно узнать, в каких разделах имеется литература, близкая по тематике, т.е. на основном разделителе (в правой части) приводятся ссылки-индексы и названия соответствующих отделов каталога. 

Есть более удобный и менее трудоемкий способ поиска литературы по систематическому каталогу – это поиск при помощи алфавитно-предметного указателя к каталогу (АПУ). Иначе АПУ называется ключом к систематическому каталогу, т.к. использование его значительно облегчает поиск и экономит время пользователя.

В алфавитно-предметном указателе приводятся в общем алфавите наименования: основных, ведущих отраслей знания, частных дисциплин и отдельных вопросов этих отраслей, всевозможных научных проблем, отдельных понятий, предметов и явлений.

Каждое из наименований сопровождается индексом отдела, в котором нужно искать книги на данную тему или по данному вопросу. В совокупности наименование темы или предмета и ее индекс составляют рубрику указателя. Название каждого вопроса, проблемы, темы записано на отдельной карточке с указанием индекса. Карточки расставляются по алфавиту первых слов по правилам расстановки в алфавитном каталоге.

Электронный каталог (ЭК) является частью справочно-библиографического аппарата библиотеки и сочетает в себе функции различных видов каталогов – алфавитного, систематического, предметного – и позволяет производить многоаспектный поиск документов по различным признакам.

ЭК раскрывает состав и содержание библиотечного фонда печатных, аудиовизуальных, электронных документов, поступивших в библиотеку с 1985 г. и по настоящее время.